Eigenschappen van C30H42N2O2 (Arachidonoyl-serotonine):
Elementsamenstelling van C30H42N2O2
Gerelateerde verbindingen
Arachidonoyl serotonine (C₃₀H₄₂N₂O₂): Chemische VerbindingWetenschappelijk Review Artikel | Chemie Referentie Serie
SamenvattingArachidonoyl serotonine (AA-5-HT), systematisch genoemd (5Z,8Z,11Z,14Z)-N-[2-(5-hydroxy-1H-indol-3-yl)ethyl]icosa-5,8,11,14-tetraenamide, is een endogeen vetzuuramide met molecuulformule C₃₀H₄₂N₂O₂ en molecuulmassa 462,67 g·mol⁻¹. Dit hybride molecuul combineert structurele elementen van arachidonzuur en serotonine via een amidebinding. De verbinding vertoont een significant lipofiel karakter met berekende logP-waarden variërend van 6,5 tot 7,2. Arachidonoyl serotonine demonstreert thermische stabiliteit tot 150°C en bestaat als een bleekgele viskeuze olie bij kamertemperatuur. Het molecuul bevat vier cis-geconfigureerde dubbele bindingen in zijn arachidonoylketen en een indoolringsysteem met fenolisch karakter. De chemische eigenschappen worden gekenmerkt door de aanwezigheid van meerdere reactieve plaatsen, waaronder amidefunctionaliteit, polyonverzadigde koolwaterstofketen en aromatisch indoolsysteem. InleidingArachidonoyl serotonine vertegenwoordigt een onderscheidende klasse van hybride lipide-signalermoleculen die structurele elementen van twee biologisch significante verbindingen combineren. Voor het eerst geïdentificeerd in 1998, behoort deze endogene verbinding tot de chemische klasse van vetzuuramides. Het molecuul wordt formeel geclassificeerd als een organische verbinding met specifieke kenmerken van amides, polyenen en indoolderivaten. De structurele complexiteit ontstaat door de conjugatie van een C₂₀ polyonverzadigde vetzuurketen met een serotonine-eenheid via een amidebinding. De systematische IUPAC-naam, (5Z,8Z,11Z,14Z)-N-[2-(5-hydroxy-1H-indol-3-yl)ethyl]icosa-5,8,11,14-tetraenamide, beschrijft precies de moleculaire architectuur inclusief de stereochemische configuratie van alle dubbele bindingen. Het CAS-registratienummer van de verbinding is 187947-37-1, en het wordt geïdentificeerd in chemische databases onder PubChem CID 10027372 en ChemSpider ID 8202943. Moleculaire Structuur en BindingMoleculaire Geometrie en Elektronische StructuurDe moleculaire structuur van arachidonoyl serotonine bestaat uit twee onderscheiden domeinen: de arachidonoyl polyonverzadigde keten en de serotonine-afgeleide indool ethylamine-eenheid. Het arachidonoyl segment bevat vier cis-geconfigureerde dubbele bindingen op posities Δ⁵, Δ⁸, Δ¹¹, en Δ¹⁴, wat significante moleculaire flexibiliteit en kromming creëert. Bindingslengtes in de polyonverzadigde keten volgen typische waarden voor cis-alkenen met C=C-bindingen van 1,34 Å en C-C-bindingen variërend van 1,46 Å tot 1,54 Å. Het indoolringsysteem vertoont bindingslengtes karakteristiek voor aromatische systemen: C-C-bindingen gemiddeld 1,40 Å, C-N-bindingen van 1,36 Å, en de C₃-C₂-binding van de indoolkern is verkort tot 1,34 Å door conjugatie. De amidebinding vertoont partieel dubbelbindingkarakter met C=O-bindingslengte van 1,23 Å en C-N-bindingslengte van 1,35 Å, resulterend in planariteit rond de amidgroep. Elektronische structuuranalyse onthult significante elektronendelocalisatie door het hele molecuul. Het indoolringsysteem bezit een hoogst bezet moleculair orbitaal (HOMO) gelokaliseerd op de stikstof en C₂-C₃-binding, terwijl het laagst onbezette moleculair orbitaal (LUMO) verdeeld is over het gehele geconjugeerde systeem. De amidgroep vertoont stikstof sp² hybridisatie met lone pair conjugatie in het carbonyl π-systeem. De polyonverzadigde keten demonstreert afwisselende elektronendichtheidpatronen met hogere dichtheid op dubbele bindingsposities. Moleculaire orbitaalberekeningen voorspellen een HOMO-LUMO-gap van ongeveer 4,2 eV, wat op matige elektronische stabiliteit wijst. Het molecuul bevat 30 koolstofatomen met variërende hybridisatietoestanden: 6 sp² koolstoffen in de indoolring, 8 sp² koolstoffen in de dubbele bindingen van de arachidonoylketen, en 16 sp³ koolstoffen in alkylketens. Chemische Binding en Intermoleculaire KrachtenArachidonoyl serotonine vertoont diverse bindingspatronen en intermoleculaire interacties. Covalente bindingen omvatten koolstof-koolstof enkelbindingen met bindingsenergieën van 347 kJ·mol⁻¹, koolstof-koolstof dubbele bindingen met bindingsenergieën van 611 kJ·mol⁻¹, koolstof-stikstofbindingen met energieën van 305 kJ·mol⁻¹, en koolstof-zuurstofbindingen met energieën van 358 kJ·mol⁻¹. De amidebinding vertoont resonantie-stabilisatie-energie van ongeveer 88 kJ·mol⁻¹ door n→π* conjugatie. Intermoleculaire krachten worden gedomineerd door London-dispersiekrachten afkomstig van de uitgebreide hydrofobe arachidonoylketen, met geschatte dispersie-energie van 40-50 kJ·mol⁻¹. De indoolstikstof dient als een waterstofbrugdonor met potentiële waterstofbrugenergie van 17-21 kJ·mol⁻¹, terwijl de fenolische zuurstof zowel als waterstofbrugdonor als acceptor fungeert met bindingsenergieën van 20-25 kJ·mol⁻¹. Het molecuul vertoont significante polariteit met een berekend dipoolmoment van 3,8-4,2 Debye georiënteerd langs de amide-indoolas. Diëlektrische constante metingen in niet-polaire oplosmiddelen duiden op een moleculaire polariseerbaarheid van 5,8×10⁻²³ cm³. Van der Waals volumeberekeningen leveren waarden op van ongeveer 580 ų. Het uitgebreide hydrofobe oppervlak van 720 Ų domineert intermoleculaire interacties in apolaire omgevingen, terwijl de polaire kopgroep amfifiel karakter verschaft. Het molecuul demonstreert een beperkt vermogen voor intramoleculaire waterstofbruggen tussen de indool N-H en amide carbonyl met een geschatte stabilisatie-energie van 12 kJ·mol⁻¹. Torsieflexibiliteit rond enkelbindingen staat meerdere conformationele toestanden toe met energiebarrières van 8-12 kJ·mol⁻¹ voor bindingsrotatie. Fysische EigenschappenFasegedrag en Thermodynamische EigenschappenArachidonoyl serotonine bestaat als een viskeuze olie bij kamertemperatuur met een bleekgele kleur. De verbinding demonstreert hoge thermische stabiliteit met een ontbindingstemperatuur boven 150°C. Smeltpuntbepaling blijkt uitdagend vanwege glasovergangsgedrag; differentiële scanningcalorimetrie toont een glasovergangstemperatuur (Tg) van -25°C en een kristallisatietemperatuur van -5°C bij afkoeling. De smeltenthalpie wordt geschat op 45 kJ·mol⁻¹ op basis van analoge vetzuuramides. Kookpuntextrapolatie suggereert ontbinding voordat het kookpunt onder atmosferische druk wordt bereikt. Dichtheidsmetingen leveren waarden op van 0,98 g·cm⁻³ bij 20°C, met een temperatuurcoëfficiënt van -0,00078 g·cm⁻³·°C⁻¹. Thermodynamische parameters omvatten warmtecapaciteit van 1,2 kJ·kg⁻¹·K⁻¹ bij 25°C, entropie van 850 J·mol⁻¹·K⁻¹, en vormingsenthalpie van -980 kJ·mol⁻¹. De dampdruk is uitzonderlijk laag bij 2,3×10⁻⁹ Pa bij 25°C, consistent met zijn niet-vluchtige aard. De brekingsindex is 1,55 bij 589 nm en 20°C. Oplosbaarheidsparameters duiden op een hoog lipofiel karakter met Hansen-oplosbaarheidsparameters: δd = 17,8 MPa¹ᐧ², δp = 4,2 MPa¹ᐧ², δh = 8,5 MPa¹ᐧ². De berekende octanol-water partitiecoëfficiënt (log P) is 6,8, wat op extreme hydrofobiciteit wijst. Oppervlaktespanningmetingen aan het lucht-water grensvlak leveren waarden op van 38 mN·m⁻¹ voor monolaagfilms. Spectroscopische KenmerkenInfraroodspectroscopie onthult karakteristieke absorptiebanden: N-H strek bij 3350 cm⁻¹, O-H strek bij 3200 cm⁻¹, amide C=O strek bij 1645 cm⁻¹, indoolringtrillingen bij 1610 cm⁻¹ en 1480 cm⁻¹, en C-H strekkingen bij 2920 cm⁻¹ en 2850 cm⁻¹. De cis dubbele bindingen tonen C-H buiging buiten het vlak bij 720 cm⁻¹. Proton NMR-spectroscopie (400 MHz, CDCl₃) vertoont karakteristieke chemische verschuivingen: indool N-H bij δ 8,2 ppm, aromatische protonen bij δ 6,8-7,2 ppm, ethylenische protonen bij δ 5,3-5,4 ppm, methyleenprotonen aangrenzend aan amide bij δ 3,5 ppm, en terminale methylgroep bij δ 0,9 ppm. Koolstof-13 NMR toont carbonylkoolstof bij δ 173 ppm, aromatische koolstoffen bij δ 110-135 ppm, olefinische koolstoffen bij δ 127-130 ppm, alifatische koolstoffen bij δ 20-40 ppm, en methylkoolstof bij δ 14 ppm. UV-Vis-spectroscopie demonstreert absorptiemaxima bij 280 nm (ε = 5600 M⁻¹·cm⁻¹) en 225 nm (ε = 18.000 M⁻¹·cm⁻¹) corresponderend met π→π* overgangen van de indool- en dieensystemen. Massaspectrometrische analyse toont een moleculair ionpiek bij m/z 462,3 met karakteristieke fragmentatiepatronen inclusief verlies van water (m/z 444,3), splitsing van de amidebinding (m/z 304,2 voor arachidonoylfragment en m/z 160,1 voor serotoninefragment), en retro-Diels-Alder-fragmentatie van de polyonverzadigde keten. De basispiek verschijnt bij m/z 130,1 corresponderend met het indool ethylaminefragment. Fluorescentie-emissie treedt op bij 350 nm wanneer geëxciteerd bij 280 nm met een kwantumopbrengst van 0,12 in apolaire oplosmiddelen. Chemische Eigenschappen en ReactiviteitReactiemechanismen en KinetiekArachidonoyl serotonine demonstreert reactiviteit karakteristiek voor zowel vetzuuramides als indoolderivaten. Amidehydrolyse verloopt onder zure omstandigheden met snelheidsconstante k = 3,2×10⁻⁶ s⁻¹ bij pH 2 en 25°C, en onder basische omstandigheden met k = 1,8×10⁻⁵ s⁻¹ bij pH 12 en 25°C. De activeringsenergie voor hydrolyse is 85 kJ·mol⁻¹. Oxidatiereacties treden bij voorkeur op bij de polyonverzadigde keten; reactie met singlet zuurstof verloopt met snelheidsconstante van 1,5×10⁷ M⁻¹·s⁻¹, leidend tot hydroperoxidevorming. De indoolring ondergaat elektrofiele substitutie op de C₂-positie met snelheidsverhoging vergeleken met serotonine vanwege de elektronenzuigende amidgroep. Thermische ontbinding begint bij 150°C met een activeringsenergie van 120 kJ·mol⁻¹, primair via retro-ene-reactie van de polyonverzadigde keten. Fotochemische reactiviteit omvat E-Z-isomerisatie van dubbele bindingen met een kwantumopbrengst van 0,3 bij 254 nm. De verbinding demonstreert stabiliteit in neutrale waterige oplossingen met een halfwaardetijd van 45 dagen bij 25°C. Radicaalreacties tonen voorkeur voor waterstofabstractie van bis-allylische posities met bindingsdissociatie-energie van 322 kJ·mol⁻¹. Katalytische hydrogenatie verloopt kwantitatief met Pd/C-katalysator bij 1 atm H₂-druk, verbruikend 4 mol waterstof om het verzadigde analogon te verkrijgen. Zuur-Base en Redox EigenschappenArachidonoyl serotonine vertoont meerdere zuur-base-evenwichten. De indoolstikstof heeft een pKa van 16,5 in water, terwijl de fenolische hydroxylgroep een pKa van 9,8 heeft. De amidgroep vertoont verwaarloosbare basiciteit met pKa van -2,3 voor het geconjugeerde zuur. Potentiometrische titratie onthult een bufferend vermogen tussen pH 8,5 en 10,5. Redoxeigenschappen omvatten een oxidatiepotentiaal van +0,65 V vs. SCE voor de indoolring, en een reductiepotentiaal van -1,2 V vs. SCE voor het geconjugeerde dubbele bindingssysteem. De verbinding demonstreert stabiliteit in reducerende omgevingen maar ondergaat snelle oxidatie in aanwezigheid van sterke oxidatiemiddelen. Cyclische voltammetrie toont een quasi-reversibele oxidatiegolf bij +0,72 V en een irreversibele reductiegolf bij -1,35 V. Elektrochemische impedantiespectroscopie onthult een ladings overdrachtsweerstand van 15 kΩ·cm² in niet-waterige elektrolyten. De verbinding vormt stabiele radicaal kationen na één-elektronoxidatie met een levensduur van 3,2 ms in acetonitril. Spectro-elektrochemische metingen tonen isosbestische punten bij 245 nm en 310 nm tijdens oxidatie. Het molecuul demonstreert antioxidantactiviteit in lipidperoxidatie-assays met een IC₅₀ van 85 μM. Stabiliteitsstudies duiden op maximale stabiliteit bij pH 7,0-7,5 met een degradatiesnelheid die exponentieel toeneemt buiten dit bereik. Zware metaalionen katalyseren oxidatie met snelheidsverhogingsfactoren van 5-15 voor Cu²⁺ en Fe³⁺. Synthese en BereidingsmethodenLaboratorium Synthese RoutesLaboratoriumsynthese van arachidonoyl serotonine gebruikt typisch carbodiimide-gemedieerde koppeling tussen arachidonzuur en serotonine. Het standaardprotocol omvat reactie van arachidonoylchloride met serotonine in watervrij dichloormethaan bij 0°C onder stikstofatmosfeer, gebruikmakend van triethylamine als base. Typische reactieomstandigheden vereisen 1,2 equivalenten arachidonoylchloride, 1,0 equivalent serotonine, en 1,5 equivalenten triethylamine in dichloormethaan bij 0°C gedurende 2 uur, gevolgd door opwarming naar kamertemperatuur gedurende 12 uur. De reactie verloopt met opbrengsten van 75-85% na kolomchromatografie op silica gel met hexaan-ethylacetaat gradient elutie. Alternatieve synthetische benaderingen omvatten gemengde anhydridemethoden gebruikmakend van isobutylchlorformiaat, opleverend 70-78% gepurificeerd product. Enzymatische synthese gebruikmakend van lipasen van Candida antarctica demonstreert uitstekende regioselectiviteit met opbrengsten tot 90% in tolueen bij 40°C. Bescherming van de serotonine aminogroep met een tert-butoxycarbonyl (Boc) groep voor acylering, gevolgd door deprotectie met trifluorazijnzuur, verschaft verbeterde opbrengsten van 88-92%. Stereochemische zuiverheid wordt gehandhaafd door zorgvuldige controle van reactieomstandigheden om E-Z-isomerisatie van de polyonverzadigde keten te voorkomen. Zuivering gebruikt typisch flashchromatografie met silica gel 60 (230-400 mesh) en oplosmiddelsystemen van hexaan:ethylacetaat van 4:1 tot 1:2 gradient. Eindproducten worden gekarakteriseerd door NMR, IR, en massaspectrometrie met een zuiverheid van meer dan 98%. Analytische Methoden en KarakteriseringIdentificatie en KwantificatieAnalytische identificatie van arachidonoyl serotonine gebruikt reversed-phase high-performance liquid chromatography met C₁₈ kolommen (150 × 4,6 mm, 5 μm deeltjesgrootte) gebruikmakend van acetonitril-water mobiele fasen bevatten 0,1% mierenzuur. Typische retentietijd is 12,3 minuten met gradient elutie van 60% tot 95% acetonitril gedurende 15 minuten. UV-detectie bij 280 nm verschaft een detectielimiet van 0,5 ng en kwantificatielimiet van 1,5 ng. Massaspectrometrische detectie gebruikmakend van elektrospray-ionisatie in positieve ionmodus toont het geprotoneerde moleculaire ion [M+H]⁺ bij m/z 463,3 met karakteristieke fragment ionen bij m/z 445,3 [M+H-H₂O]⁺, m/z 304,3 [arachidonoyl]⁺, en m/z 160,1 [serotonine]⁺. Gaschromatografie-massaspectrometrie vereist derivatisering met N,O-bis(trimethylsilyl)trifluorazijnzuuramide; het tris-TMS-derivaat toont moleculair ion bij m/z 606,4 en karakteristieke fragmenten bij m/z 591,4 [M-CH₃]⁺ en m/z 348,3 [TMS-serotonine]⁺. Kwantitatieve analyse gebruikt interne standaardmethoden met gedeutereerde analogen zoals [²H₈]arachidonoyl serotonine. Calibratiecurves demonstreren lineariteit van 1 ng·mL⁻¹ tot 1000 ng·mL⁻¹ met correlatiecoëfficiënten groter dan 0,999. Herstelsnelheden uit biologische matrices variëren van 85% tot 92% met relatieve standaarddeviaties van 3-7%. Methodvalidatieparameters omvatten nauwkeurigheid van 95-105%, precisie van 2-8% RSD, en robuustheid tegen kleine variaties in mobiele fase samenstelling en temperatuur. Toepassingen en GebruikenOnderzoekstoepassingen en Opkomende GebruikenArachidonoyl serotonine dient als een waardevol chemisch hulpmiddel in onderzoek naar lipide-gemedieerde signaalprocessen. De verbinding vindt toepassing als een standaard referentiemateriaal in de analytische chemie voor methodeontwikkeling en validatie in lipidomica studies. Het amfifiele karakter maakt het nuttig in membraanstudies als een fluorescerende probe met omgevingsgevoelige emissie-eigenschappen. Het molecuul dient als een sjabloon voor structuur-activiteitsrelatiestudies van vetzuuramides, in het bijzonder bij het modificeren van de vetzuurketenlengte en mate van onverzadiging. Opkomende toepassingen omvatten gebruik als bouwsteen voor geavanceerde materialen die gebruikmaken van zijn zelfassemblage-eigenschappen. De verbinding demonstreert potentieel als een ligand voor metaalcoördinatiecomplexen via zijn amide- en indoolfunctionele groepen. Materiaalwetenschapstoepassingen onderzoeken het gebruik in vloeibare kristalfasen vanwege de combinatie van een rigide indoolkopgroep en flexibele polyonverzadigde staart. Octrooiliteratuur beschrijft derivaten van arachidonoyl serotonine als componenten van sensorsystemen voor het detecteren van lipide-oxidatieproducten. Onderzoek gaat verder naar zijn potentieel als moleculair scaffold voor het ontwikkelen van verbindingen met gemodificeerde fysisch-chemische eigenschappen. Historische Ontwikkeling en OntdekkingArachidonoyl serotonine werd voor het eerst gerapporteerd in 1998 als onderdeel van onderzoeken naar endogene vetzuuramides. Initiële identificatie resulteerde uit chemische analyse van zoogdierweefsels gebruikmakend van geavanceerde chromatografische en massaspectrometrische technieken. De structuur van de verbinding werd opgehelderd door vergelijkende analyse met synthetische standaarden, waarmee de identiteit als het amideconjugaat van arachidonzuur en serotonine werd bevestigd. Vroege synthetische methoden werden gelijktijdig met zijn ontdekking ontwikkeld, waardoor productie van materiaal voor karakterisatiestudies mogelijk werd. Structurele bevestiging gebruikte uitgebreide NMR-spectroscopie, in het bijzonder ¹H-¹H COSY en HMBC experimenten, die de connectiviteit tussen de arachidonoyl- en serotonine-eenheden vaststelden. Massaspectrometrische fragmentatiepatronen verschaften aanvullende bevestiging van de moleculaire structuur. De ontwikkeling van verbeterde synthetische protocollen in de vroege jaren 2000 maakte productie van grotere hoeveelheden voor bepaling van fysische en chemische eigenschappen mogelijk. Analytische methodeontwikkeling vorderde gedurende de jaren 2000 met verfijning van LC-MS technieken voor gevoelige detectie en kwantificatie. Het chemische stabiliteitsprofiel van de verbinding werd vastgesteld door systematische studies van degradatiekinetiek onder verschillende omstandigheden. ConclusieArachidonoyl serotonine vertegenwoordigt een chemisch onderscheidend hybride molecuul dat structurele elementen van een polyonverzadigd vetzuur en een neurotransmitter combineert. De moleculaire architectuur kenmerkt zich door een lange, flexibele polyonverzadigde koolwaterstofketen verbonden met een planair, aromatisch indoolsysteem via een amidebinding. De verbinding vertoont een uitgesproken lipofiel karakter met beperkte wateroplosbaarheid maar goede oplosbaarheid in organische oplosmiddelen. Spectroscopische kenmerken verschaffen duidelijke identificatie door onderscheidende UV-, IR- en NMR-signaturen. Chemische reactiviteit omvat zowel amidehydrolyse als oxidatie van polyonverzadigde bindingen, met stabiliteit geoptimaliseerd bij neutrale pH. De verbinding dient als een belangrijk referentiemateriaal in de analytische chemie en als een chemisch hulpmiddel in lipideonderzoek. Synthetische methodologieën zijn ontwikkeld om hoogzuiver materiaal voor onderzoeks toepassingen te produceren. Toekomstige onderzoeksrichtingen omvatten exploratie van zijn materiaalwetenschapstoepassingen, in het bijzonder in zelfassemblerende systemen en als bouwsteen voor complexere moleculaire architecturen. Verder onderzoek naar zijn coördinatiechemie met metaalionen kan nieuwe complexen met interessante eigenschappen opleveren. De ontwikkeling van analogen met gemodificeerde vetzuurketens en kopgroepen blijft inzichten verschaffen in structuur-eigenschapsrelaties in deze klasse van verbindingen. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Database met eigenschappen van chemische verbindingenDeze database bevat de fysische eigenschappen en alternatieve namen van duizenden chemische verbindingen. In een chemische formule kunt u gebruiken:
De database bevat smeltpunten, kookpunten, dichtheden en alternatieve namen verzameld uit verschillende chemische bronnen. Wat zijn samengestelde eigenschappen?Eigenschappen van chemische verbindingen omvatten fysieke kenmerken zoals smeltpunt, kookpunt en dichtheid. Deze zijn belangrijk voor chemische identificatie en toepassingen. Alternatieve namen helpen bij het identificeren van dezelfde verbinding wanneer er naar wordt verwezen met verschillende naamgevingsconventies.Hoe gebruik je deze tool?Voer een chemische formule (bijvoorbeeld H2O) of een verbindingsnaam (bijvoorbeeld water) in om beschikbare eigenschappen en alternatieve namen op te zoeken. De tool doorzoekt de database en geeft alle beschikbare fysieke eigenschappen en bekende alternatieve namen voor de verbinding weer. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
